1993年底，周穗安与麦超的矛盾彻底爆发。谈及这段过往，周穗安表示：“其实那只是管理者与被管理者之间的正常冲突，现在麦超也成为了教练，他应该能理解我当时的想法。”当时，13名球员集体向市体委上书，要求周穗安卸任，“周穗安事件”在足坛引起轩然大波，在职业联赛备战期，他甚至未能随队前往昆明集训。 当被问及“众多球员反对，体委却顶住压力让你继续带队，你为何仍有勇气与信心坚持”时，周穗安回答：“我并不害怕，这些队员中有不少是我从小带大的，我始终相信他们。”据悉，当时部分球员在签名后，还悄悄将内情告知了周穗安。 尽管备战不足导致赛季开局不利，但周穗安最终还是带领广州队夺得联赛亚军，胡志军也成为当季射手王。由于多次带领球队获得亚军，周穗安被贴上了“千年老二”的标签。为摆脱这一称号，1994年后，他计划继续冲击联赛冠军：后防线引进李强，前锋线则有意签下高中锋黎兵与宿茂臻，两人也表达了加盟意愿。不料，广东宏远主帅陈亦明抢先签下黎兵，山东足坛高层又出面阻止宿茂臻前往广州。引援失败后，广州队在1995年战绩下滑，周穗安最终被解职。 2000年，广州队陷入保级困境，周穗安再度出山。在东较场举行的关键战役中，凭借曾庆高的进球，广州队成功保级，留住了职业足球的火种。即便如今，周穗安仍能清晰说出当时球队的主力阵容：“比赛结束后，我在休息室里与队员们相拥而泣，那是发自内心的激动。广州足球当时走到那样艰难的境地，幸好最终挺了过来。如果连这颗‘种子’都没保住，真不知道未来还有没有冲超的机会。” 2001年联赛中期，周穗安再次接过教鞭，协助广州吉利队冲击甲A。但在与上海中远队的关键比赛中，球队失利，赛后周穗安当着对方主帅徐根宝的面批评裁判判罚。徐根宝当时劝他：“小周，别再说这些了，我们以后还要在这个圈子里立足。”周穗安后来坦言：“现在回想起来，根宝当时是在保护我，只是我当时太生气了，根本顾不上这些。” 2002年，广州队进行大规模阵容调整，实力大幅下降，周穗安在赛季中途下课。2003年，他再次上任，目标是带领这支年轻球队在三年内实现冲超。然而，由于复杂的队内人事关系，加上在引援问题上与管理层意见不合，周穗安最终选择辞职，这也是他最后一次执教广州足球队。 纵观周穗安的执教生涯，他带领广州队获得两次甲级联赛亚军、一次乙级联赛亚军、一次足协杯亚军、一次城运会亚军，成功带领球队完成一次甲B保级，累计执教广州队10个赛季，却经历了6次下课——这样的纪录不仅前无古人，或许也后无来者。 采访结束时，周穗安委托记者传递心声：“广州队成功冲超，我由衷地感到高兴。感谢沈指导、感谢广药集团、感谢全体队员，希望投资方能继续支持广州足球，也祝愿球队在中超赛场上越走越好！” ——2007年10月8日《羊城晚报》
