新中国成立后，清华大学最大的战略失误有两个：一是1952年没有扛住压力，把全部理科连老师带学生拱手送给北大；二是2003年没有一鼓作气把协和划至自己麾下，只留了一个合作办学的尾巴。 主要信源：（中国教育报——教育回望：1952年完成高校院系调整） 上世纪五十年代，新中国为了快速推进工业化，急需大量工程技术人才。 为此，全国的高等教育进行了一次大规模调整，核心是学习苏联模式，将许多综合性大学拆分，重点建设一批专业性的工科院校。 在这场波及全国的行动中，清华大学经历了根本性的转变。 调整前的清华，是一所学科齐全的综合性大学。 为了服务国家建设多科性工业大学的目标，它的文学院、理学院整体并入了北京大学，许多知名的理科教授和完整的教学设备也随之调离。 同时，它的航空，地质，化工等系科也被调出，用以支援新成立的北京航空学院、北京钢铁学院、石油学院等一批专门学院。 对于这些调动，当时的师生们大多抱着为国家做贡献的想法，服从安排，奔赴新的岗位，整个调整过程推进得比较顺利。 调整之后，清华大学的面貌彻底改变了。 它集中全部精力，专注于发展机械，土木，水利，电机等工程技术学科，并且很快就在这些领域做到了顶尖水平。 在接下来的几十年里，学校为国家培养了数不清的优秀工程师，从基础的建设工程到尖端的国防科技项目，比如“两弹一星”，都凝聚着清华工科人才的心血。 清华也因此成为国内外公认的工科强校，为中国工业化建设立下了汗马功劳。 但是，这种调整也带来了一些长远的影响。 一所顶尖的大学，不仅需要强大的工科，也需要深厚的基础理科，比如数学，物理，化学，作为科学创新的根基。 清华的理科力量被调走之后，学校在很长一段时间里，确实面临着“工科很强，理科跟不上”的局面。 这就像一个大力士，力气很大，但少了一些内在的巧劲和持续创新的源泉。 学校自己也意识到了这个问题，所以很早就开始想办法弥补。 他们并没有大张旗鼓地重建，而是在强大的工科体系内部，悄悄地重新播撒理科的种子。 一点一点地恢复数学、物理等基础学科的教学和研究。 这个过程非常漫长，从设立基础教研室，到重新成立物理系，数学系，再到建成一个比较完善的理科体系，前前后后用了将近五十年的时间。 而且，新生长起来的理科，也不是简单地重复过去，而是特别注重和清华强大的工科优势相结合。 发展出了具有鲜明特色的交叉学科，走出了另一条成功的路子。 时间快进到上世纪末，中国高校掀起了一股合并的热潮。 许多大学通过合并，迅速补上了学科上的短板，实力大增。 最典型的例子就是北京大学合并了北京医科大学。 当时的清华大学，各方面都很出色，但唯独缺少一个实力强大的医学院，这被认为是建成世界一流大学的一个重要短板。 很自然地，他们把目光投向了国内医学的殿堂——北京协和医学院。 双方都有合作的意愿，经过谈判。 从本世纪初开始，协和医学院的王牌专业——临床医学八年制的学生，前期的基础阶段在清华学习，招生也纳入清华的计划。 看起来，这是一桩完美的“联姻”。 真正走到一起，却远比想象中复杂。 北京协和医学院历史辉煌，地位特殊，有着自己非常独立和成熟的管理体系，学术传统和隶属关系。 两所顶尖学府在人事安排，资源分配，办学理念等许多具体问题上，存在着复杂的现实考量。 最终，双方没能实现许多人期望的完全合并，而是采取了一种“合作共建”的模式。 协和依然保持其独立性，只是在某些领域与清华深度合作。 这件事，常被外界看作是清华错失了一个宝贵机会。 但换一个角度看，这次未竟的合并，反而促使清华下定决心，要完全依靠自己的力量，从头开始建设一个高水平的医学院。 实际上，在寻求与协和合作的同时，清华大学自己的医学院在2001年就已经成立了。 当合并之路遇到现实阻碍后，清华发展自家医学的步伐变得更加坚定和清晰。 他们从零开始，搭建基础医学，药学，公共卫生等学科，花费巨大精力建设和管理自己的附属医院，比如北京清华长庚医院。 这条路无疑更加艰难，需要自建体系、自培师资、自寻资源。 但这么做的另一个好处是，可以完全按照清华的整体规划，将医学的发展与学校最强的工程学科，信息学科，理科进行深度融合。 全力探索“医工结合”，“智慧医疗”等前沿方向，这或许能开创出一种不同于传统医学院发展的新路径。 而协和医学院，也同样继续着自身的探索，并与北京航空航天大学等其他顶尖工科院校开展了新的合作。
